More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0822 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 356 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  54.95 
 
 		 335 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  54.95 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  52.54 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  46.57 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  44.28 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  45.2 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  42.86 
 
 		 326 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  44.86 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  44.24 
 
 		 326 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  39.77 
 
 		 344 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  43.89 
 
 		 319 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  42.27 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  34.97 
 
 		 316 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  34.98 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  35.79 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  35.79 
 
 		 309 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  34.23 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  31.93 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  31.86 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.88 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.06 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 305 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.65 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  30.41 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.66 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  31.73 
 
 		 309 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  29.26 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 306 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  29.63 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 		 301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  31.94 
 
 		 326 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  34.06 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.25 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.93 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  29.15 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  29.45 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  28.39 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  31.93 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.71 
 
 		 312 aa  140  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  29.75 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  29.75 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 303 aa  139  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 292 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 292 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 		 301 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  29 
 
 		 291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.7 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  27.02 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  28.87 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  28.81 
 
 		 298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 		 292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  26.96 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  27.93 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  26.53 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  26.13 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  26.93 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.95 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  26.28 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.91 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  27.37 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>