More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2846 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 335 aa  688    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  51.85 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.1 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 302 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.19 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  30.32 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.25 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  28.73 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.51 
 
 		 344 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.95 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  31.05 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 292 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  31.05 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  32.37 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  32.68 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 313 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  33.08 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.53 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  29.1 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  30.24 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  28.43 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.13 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  28.67 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  28.67 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  30.86 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  30.71 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  28.77 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  26.42 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  27.25 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.04 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.81 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.02 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.41 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.21 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  26.61 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.92 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.41 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.41 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.41 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.41 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.34 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.41 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.1 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.76 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.64 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.79 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  28.12 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>