More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3046 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 336 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  44.44 
 
 		 310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  39.26 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  38.87 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  37.41 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  35.34 
 
 		 305 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  39.1 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  36.82 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  36.15 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.09 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  35.81 
 
 		 309 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  34.47 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  36 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  34.48 
 
 		 298 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  35.24 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  30.45 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  38.11 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.36 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  48.33 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  34.4 
 
 		 301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  30.45 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  30.45 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  30.1 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  37.37 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35.57 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  34.51 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  47.28 
 
 		 497 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  34.63 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.78 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  34.27 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 302 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  32.5 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  33.1 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  34.29 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  33.57 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.88 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  33.9 
 
 		 344 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  35.36 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.51 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  33 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  30.56 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  34.84 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  31.32 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  28.82 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.8 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  34.26 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  30.36 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.62 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  30.36 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  28.92 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 		 289 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  28.33 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  32.43 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  32.5 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.82 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  31.14 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  28.28 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>