More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2998 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 328 aa  674    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  35.58 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  36.56 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  35.5 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  34.91 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  34.65 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  39.26 
 
 		 336 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  34.7 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.93 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 		 292 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  31.78 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  35.92 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  36.21 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  37.07 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  34.49 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  36.51 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  34.49 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.6 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  34.39 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  34.33 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 303 aa  169  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  33.84 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.11 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.19 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  33.85 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.19 
 
 		 344 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  33.74 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.66 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.07 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  31.5 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 292 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.24 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  40.86 
 
 		 494 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  31.66 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  32.7 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  28.81 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  31.74 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30.54 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.27 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  31.04 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  39.89 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  30.53 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  30.53 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  30.89 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  28.61 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.91 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  26.63 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  28.31 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  30.03 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  31.71 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  30.03 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.34 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  30.03 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.22 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  27.16 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.34 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  27.08 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.34 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  27.08 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.06 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>