More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1215 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 309 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  43.23 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  38.8 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  40.07 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  38.34 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.8 
 
 		 349 aa  241  7.999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  39.76 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  38.29 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  37.34 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  37.34 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  37.34 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  36.91 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  37.03 
 
 		 316 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  37.03 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  36.91 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  37.03 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  37.01 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.07 
 
 		 514 aa  221  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  37.03 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  37.03 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  38.54 
 
 		 316 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  39.62 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  34.35 
 
 		 328 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  39.12 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  42.81 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  39.62 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  34.08 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  36.77 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  37.58 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  39.8 
 
 		 506 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  37.01 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  37.88 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.74 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  40.67 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  33.99 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  38.54 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  35.89 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  41.67 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  36.5 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  35.9 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  38.25 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  36.43 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  35.81 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  35.74 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  36.62 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  36.31 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.42 
 
 		 323 aa  178  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  33.22 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  34.74 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  35.11 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  37.05 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  32.37 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  36.1 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  32.05 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  38.43 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  36.75 
 
 		 353 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  35.87 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  36.71 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  36.81 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  39.19 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  29.91 
 
 		 333 aa  168  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  33.04 
 
 		 358 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  34.84 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  37.8 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  29.56 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30.37 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  38.87 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  32.9 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  35.17 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  33.77 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.69 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  34.85 
 
 		 293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  36.91 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  36.89 
 
 		 292 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  35.56 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.28 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  37.41 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  31.5 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.74 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>