More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0833 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 345 aa  699    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  44.16 
 
 		 292 aa  242  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30.61 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  31.37 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  34.33 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.28 
 
 		 282 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  32.73 
 
 		 310 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  32.02 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  32.02 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  34.01 
 
 		 296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  31.71 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.82 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.82 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.91 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  30.82 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.82 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  35.25 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.61 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 293 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  31.4 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  32.33 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.81 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.76 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  36.12 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.43 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.76 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  35.42 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.25 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.25 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 296 aa  143  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  31.19 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  29.78 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  30.37 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.88 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  30.2 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  32 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  32.19 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  33.75 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  30.37 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  25.95 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.48 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.19 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 		 353 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  26.06 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  30.47 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  31.99 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  30.85 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  28.3 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  31.74 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  32.71 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  31.99 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  29.56 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  38.69 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 303 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  26.6 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.16 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.6 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.08 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>