More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1891 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  100 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  40.47 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  40 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  40 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  40.13 
 
 		 290 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.8 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  44.44 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  41.18 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  41.45 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  38.61 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  39.66 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  38.33 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  40.46 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  40 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  37.85 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  42.26 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  35.92 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  35.28 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  35.5 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  36.05 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  38.08 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  38.69 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  35.94 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  37.41 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  34.32 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  30.52 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  37.05 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  33.11 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 		 323 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  36.67 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.34 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.02 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  34.77 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.84 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32.54 
 
 		 345 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  31.35 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  36.51 
 
 		 469 aa  149  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  31.68 
 
 		 298 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 		 318 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  31.92 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.44 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 		 332 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  31.74 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  41.36 
 
 		 345 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.05 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.05 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.05 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.35 
 
 		 514 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.44 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 316 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.75 
 
 		 316 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.75 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.83 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.13 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  30.91 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  33.77 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  26.14 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  28.23 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  28.23 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  33.2 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.43 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  25.43 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  26.8 
 
 		 506 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.04 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.57 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  27.54 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  24.67 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.43 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  23.31 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  30.83 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>