More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2226 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 323 aa  664    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  44.56 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  44.22 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  33.02 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.54 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  38.06 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.39 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.52 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  34 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  34.34 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  37 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  33.21 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  31.23 
 
 		 322 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.97 
 
 		 506 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  32.96 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  30.67 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.44 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  30.65 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  32.08 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.62 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.62 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  32.98 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  33.08 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.38 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28.28 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.69 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.54 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.56 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  27.61 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.81 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.81 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.62 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  31.17 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.88 
 
 		 303 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  29.26 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.39 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  27.27 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  28.94 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  32.55 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  27.27 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  26.3 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  28.76 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  26.77 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>