More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0491 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 318 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  66.36 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  63.24 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  55.48 
 
 		 304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  55.81 
 
 		 304 aa  342  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  52.26 
 
 		 333 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  50 
 
 		 321 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  38.24 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  39.12 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  34.07 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  34.07 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  33.75 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  33.75 
 
 		 316 aa  212  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  33.75 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  33.75 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  33.75 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  34.07 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  32.81 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  34.57 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.48 
 
 		 514 aa  199  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  36 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  32.45 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  33.84 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.76 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  35.9 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  35.52 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  29.26 
 
 		 293 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.62 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.62 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  35.22 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  33.97 
 
 		 265 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  30.94 
 
 		 506 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  35.34 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  28.17 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  28.17 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.04 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  36.04 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.05 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18230  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.71 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  35 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  29.93 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.36 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.97 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.29 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  29.55 
 
 		 322 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  27.55 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  33.45 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  26.58 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  28.78 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  34.28 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28.35 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.88 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  32.24 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  27.07 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.34 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  27.07 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  27.07 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  27.53 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.22 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>