More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0993 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  100 
 
 
323 aa  661    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  46.42 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  45.42 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  40.19 
 
 
290 aa  256  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  41.72 
 
 
310 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  41.4 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  40.51 
 
 
290 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  40.19 
 
 
290 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  36.12 
 
 
307 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  39.16 
 
 
302 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  37.98 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  41.45 
 
 
288 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  38.89 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  37.42 
 
 
323 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  37.11 
 
 
335 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 
293 aa  215  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  39.05 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  38.32 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  37.96 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  40.07 
 
 
312 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  37.87 
 
 
300 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 
300 aa  210  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  36.36 
 
 
292 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  39.02 
 
 
296 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.06 
 
 
282 aa  200  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  38.21 
 
 
293 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.52 
 
 
345 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  37.19 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  31.73 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  35.25 
 
 
313 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.24 
 
 
296 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  35.31 
 
 
299 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  33.45 
 
 
294 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.48 
 
 
296 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.9 
 
 
291 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 
345 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.72 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 
306 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  33.67 
 
 
318 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.45 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 
317 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 
328 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 
353 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 
309 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  30.03 
 
 
316 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.37 
 
 
323 aa  146  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  30.59 
 
 
316 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.53 
 
 
298 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  30.15 
 
 
316 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 
292 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.21 
 
 
298 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  30.57 
 
 
314 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.17 
 
 
514 aa  142  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 
313 aa  142  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  33.66 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.61 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  41.98 
 
 
469 aa  140  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.61 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.34 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.61 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.79 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.28 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  32.82 
 
 
305 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.38 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  28.9 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 
303 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.99 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28 
 
 
302 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.99 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  25.15 
 
 
328 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 
276 aa  126  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 
301 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 
301 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
365 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.62 
 
 
292 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 
333 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 
308 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 
314 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  25.63 
 
 
298 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 
303 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  26.48 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  28.73 
 
 
293 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 
346 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  28.07 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
316 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 
318 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  26.04 
 
 
304 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>