More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3176 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 292 aa  594  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  61.64 
 
 		 292 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  59.59 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  59.59 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  58.9 
 
 		 292 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  60.96 
 
 		 292 aa  361  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  56.25 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  56.99 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  55.96 
 
 		 298 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  52.54 
 
 		 301 aa  319  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  54.23 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  53.52 
 
 		 299 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  54.28 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  48.31 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  47.49 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  48.45 
 
 		 291 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  47.72 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  44.56 
 
 		 303 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  48.21 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  45.03 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  48.36 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  48.15 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  43.89 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  46.58 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  44.71 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  45.94 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  45.18 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  49.3 
 
 		 289 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  45.15 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  44.97 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  46.76 
 
 		 321 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  48.16 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  46.08 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  42.53 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  45.69 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.41 
 
 		 315 aa  231  9e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  39.33 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  40.65 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  41.82 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3500  periplasmic solute binding protein  43.31 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  43.01 
 
 		 309 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  34.68 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  34.46 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  31.31 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 303 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.13 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  34.24 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  31.7 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  33.57 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  33.33 
 
 		 344 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  38.55 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.84 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.52 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.52 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.52 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  35.25 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.18 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  36.23 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.69 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.18 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  31.62 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  31.62 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  31.7 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  29.12 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  32.85 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  31.16 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  28.66 
 
 		 356 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  28.38 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 335 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>