More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1397 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 299 aa  613  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  54.45 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  52.36 
 
 		 300 aa  325  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  54.03 
 
 		 305 aa  323  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  52.05 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  54.32 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  52.65 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  51.75 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  53.58 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  53.41 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  48.03 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  46.67 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  47.47 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  45.55 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  43.92 
 
 		 315 aa  278  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  46.46 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  42.81 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  46.21 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  42.24 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  45.65 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  43.09 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  39.02 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  40.38 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  38.23 
 
 		 370 aa  225  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  35.53 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  34.24 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  35.38 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.61 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  30.1 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.99 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  31.72 
 
 		 344 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.96 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  33.91 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  35.34 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  34.51 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  30.52 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.17 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  30.52 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  30.52 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  29.18 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 		 333 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  29.62 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  31.47 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.77 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  31.77 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  31.54 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  32.75 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.9 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.72 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0338  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.24 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.166194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  31.42 
 
 		 321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.52 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  30.1 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  28.77 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.79 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  32.31 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  31.49 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.39 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.67 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.83 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.21 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.16 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  30.99 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  30.99 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>