More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0053 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 313 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.88 
 
 		 303 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.31 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  28.92 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.92 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.45 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  26.76 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.3 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  29.3 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.44 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  28.7 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  27.56 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 371 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  28.05 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  24.92 
 
 		 344 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.39 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.45 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.27 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  26.83 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  26.67 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.67 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  26.18 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.62 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.8 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.11 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  24.61 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  22.68 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  23.97 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  22.98 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.58 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.9 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.22 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  26.9 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.48 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.58 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.5 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.58 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  30.91 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  22.85 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  23.08 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.28 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.4 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.9 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  23.51 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  26.74 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  23.25 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  25.49 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  26.28 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  28.66 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  25.39 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>