More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5661 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 291 aa  593  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  50.36 
 
 		 302 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  48.77 
 
 		 292 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  47.78 
 
 		 303 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  48.45 
 
 		 292 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  50.17 
 
 		 316 aa  284  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  48.77 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  46.96 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  49.83 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  49.66 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  48.97 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  47.52 
 
 		 298 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  47.22 
 
 		 301 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  46.32 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  49.13 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  48.2 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  47.06 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  46.53 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  46.67 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  48 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  45.75 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  47.84 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  45.27 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  48.67 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  46.89 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  45.88 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  43.42 
 
 		 301 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  46.45 
 
 		 299 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  44.14 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  47.52 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  46.23 
 
 		 289 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.52 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  46.69 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  43.64 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  44.68 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  45.48 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  40.26 
 
 		 327 aa  242  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  43 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  44.03 
 
 		 320 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  44.07 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3500  periplasmic solute binding protein  45.07 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  43.94 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  36.7 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  36.3 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  38.98 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  34.47 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.68 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  34.95 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  34.28 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  35.04 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.68 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  37.05 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.68 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  35.82 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 371 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  35.4 
 
 		 324 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  32.37 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  31.99 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  34.78 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  36 
 
 		 301 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  32.47 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  33.45 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  33.45 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.27 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.33 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  31.54 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.88 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.88 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.87 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  32.84 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.53 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.53 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.53 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.11 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  33.33 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.12 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  31.17 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  33.21 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  34.3 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  32.23 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  31.75 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  33.21 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.75 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>