More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3980 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 354 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  51.32 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  53.13 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  51.03 
 
 		 335 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  47.51 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  45.4 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  43.06 
 
 		 371 aa  288  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  46.11 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  45.65 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  41.79 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  46.03 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  42.63 
 
 		 344 aa  258  8e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  42.54 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  33.89 
 
 		 346 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 307 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  31.51 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.51 
 
 		 298 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.81 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 370 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  30.77 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  30.46 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  27.6 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  30.19 
 
 		 293 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  28.85 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.16 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.69 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  28.31 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  28.94 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  28.31 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  30.32 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  30.93 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  27.67 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  29.61 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.32 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.69 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.38 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  29.74 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  24.43 
 
 		 301 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  27.44 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  27.79 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.19 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.35 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  28.07 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  25.15 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.16 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 		 309 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 		 309 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  26.6 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>