More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1724 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  73.81 
 
 		 315 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  51.99 
 
 		 312 aa  340  1e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  60.5 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  52.61 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  55.48 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  53.8 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  49.84 
 
 		 299 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  50.9 
 
 		 303 aa  312  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  54.32 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  55.99 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  47.88 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  48.7 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  54.31 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  45.21 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  50.18 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  47.31 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  52.14 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  43.82 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  40.45 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  44.73 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  43.21 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  34.53 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  37.42 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  34.3 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  34.63 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  33.88 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  34.63 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  36.13 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  35.31 
 
 		 371 aa  188  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  37.41 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  35.84 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  38.79 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  36.45 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  35.2 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  37.72 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  35.76 
 
 		 344 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  36.49 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.97 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  36.48 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  34.94 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  32.98 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.96 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  35.84 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  36.65 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.29 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  28.28 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  28.28 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  35.26 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  36.39 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  35.58 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  35.54 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  40.5 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  26.8 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.66 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  34.73 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  31.71 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  31.71 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  34.94 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  28.25 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  35.67 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  31.39 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  27.45 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>