More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 		 319 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  50 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  39.02 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  42.96 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  43.77 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  44.19 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  43.21 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  37.7 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  43.21 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  41.52 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  40.07 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  44.29 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  42.16 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  38.93 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  34.59 
 
 		 311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  35.4 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  39.65 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.37 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  38.16 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  41.4 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  38.29 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  36.27 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  32.18 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.29 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  29.87 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.43 
 
 		 344 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  29.15 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  29.15 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  29.15 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  34.28 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  34.75 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  31.74 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  32.53 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  28.33 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  34.14 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.11 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  28.11 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  34.42 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  30.1 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.89 
 
 		 298 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  28.07 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  27.73 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  27.73 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.11 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  24.13 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  27.62 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  24.13 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  27.62 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.41 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  34.39 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.41 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  25.87 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.82 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  35.14 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  32.49 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  29.56 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  32.79 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.13 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  27.5 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>