More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1071 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  55.07 
 
 		 302 aa  315  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  57.45 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  54.58 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  50 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5108  periplasmic solute binding protein  51.42 
 
 		 212 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829709  normal  0.108422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4809  periplasmic solute binding protein  50.94 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4723  periplasmic solute binding protein  50.96 
 
 		 208 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  38.71 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 319 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 371 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  36.61 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.54 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.97 
 
 		 331 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.33 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.48 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  43.18 
 
 		 494 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  32.43 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  31.39 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  34.63 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.22 
 
 		 319 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.24 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.27 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  40.91 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.96 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  31.29 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  31.29 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  28.25 
 
 		 321 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  31.11 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  26.38 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  30.85 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.27 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  31.86 
 
 		 370 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.3 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  30.18 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.32 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.32 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.57 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.25 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  31.63 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.57 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  33 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  27.33 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.18 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.78 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.68 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.76 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.76 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.51 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.34 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.42 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.42 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.42 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  25.75 
 
 		 345 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 		 347 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.25 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.67 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.09 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>