More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4723 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4723  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5108  periplasmic solute binding protein  99.04 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829709  normal  0.108422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4809  periplasmic solute binding protein  99.52 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  70.05 
 
 		 302 aa  291  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  53.81 
 
 		 321 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  52.88 
 
 		 325 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  51.74 
 
 		 306 aa  209  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  48.56 
 
 		 304 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  42.37 
 
 		 497 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  42.05 
 
 		 494 aa  131  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  39.78 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  40.11 
 
 		 346 aa  128  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  40.7 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  40.31 
 
 		 346 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  36.16 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  38.2 
 
 		 353 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 319 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  33.52 
 
 		 326 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  36.36 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.95 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  35.12 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 371 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  34.66 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  30.68 
 
 		 354 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  32 
 
 		 335 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  26.7 
 
 		 311 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30 
 
 		 331 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 		 297 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  31.5 
 
 		 297 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  29.94 
 
 		 326 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  30.24 
 
 		 337 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  26.02 
 
 		 344 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 335 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  33.5 
 
 		 301 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 		 325 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 306 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 299 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  36 
 
 		 310 aa  92  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  24.88 
 
 		 311 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 		 310 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  28.29 
 
 		 320 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  27.72 
 
 		 305 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  29.76 
 
 		 287 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  27.72 
 
 		 305 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  30.68 
 
 		 345 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  27.72 
 
 		 305 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  27.72 
 
 		 305 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  27.72 
 
 		 305 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.68 
 
 		 313 aa  88.6  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  26.21 
 
 		 302 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 		 324 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  29.47 
 
 		 310 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.73 
 
 		 311 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 		 300 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  29.5 
 
 		 296 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 320 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  24.76 
 
 		 302 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  25.12 
 
 		 300 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.49 
 
 		 309 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 		 311 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.1 
 
 		 303 aa  85.9  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  28.64 
 
 		 305 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 306 aa  85.5  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  23.9 
 
 		 311 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  23.9 
 
 		 311 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  34.25 
 
 		 309 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  33.52 
 
 		 315 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  35.56 
 
 		 514 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 313 aa  84.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  27.14 
 
 		 308 aa  84.7  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  24.76 
 
 		 299 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.37 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.37 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  28.5 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.44 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  35.16 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  26.13 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  25.37 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.02 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.36 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.37 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 509 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  34.08 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  24.88 
 
 		 304 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  26.11 
 
 		 326 aa  81.6  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  31.53 
 
 		 571 aa  81.6  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 		 301 aa  81.3  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  25.37 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.13 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  26.87 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  31.28 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>