More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2856 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 325 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  60 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  52.98 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  56.33 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  51.16 
 
 		 304 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5108  periplasmic solute binding protein  54.07 
 
 		 212 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829709  normal  0.108422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4809  periplasmic solute binding protein  53.59 
 
 		 212 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4723  periplasmic solute binding protein  52.88 
 
 		 208 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  38.41 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  35.33 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  34.47 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  35.18 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  31.33 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  34.01 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  44 
 
 		 494 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  42.29 
 
 		 497 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  35.14 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.42 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  28.83 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  32.53 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  27.48 
 
 		 311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  27.44 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  27.33 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  26.69 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.68 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  30.46 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.91 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.67 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  26.18 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  27.27 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  31.42 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.6 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.81 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.32 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  23.55 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  26.48 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  28.36 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  25.39 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 306 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.89 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  24.56 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  26.17 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.76 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  26.48 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  32.79 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.57 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  26.67 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>