More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1995 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 370 aa  752    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  43.43 
 
 		 315 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  38.23 
 
 		 299 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  42.2 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  37.09 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  44.1 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  39.07 
 
 		 300 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  39.64 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  36 
 
 		 311 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  40 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  36.28 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  40.14 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  38.6 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  39.79 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  38.73 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  42.71 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  37.94 
 
 		 309 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  38.28 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.13 
 
 		 303 aa  189  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  35.59 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.27 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  36.96 
 
 		 306 aa  178  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 313 aa  160  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.28 
 
 		 344 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 335 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  32.29 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 319 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 		 317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 		 294 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0338  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.41 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.166194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.48 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  26.93 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 320 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 		 303 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  27.47 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.32 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.08 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.74 
 
 		 298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.17 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  26.33 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  28.97 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.05 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  24.92 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  29.84 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  27.49 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  25.57 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  25.55 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  27.09 
 
 		 304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.22 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  27.68 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  27.14 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  31.86 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  28.68 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.76 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  26.64 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>