More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0338 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0338  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 326 aa  675    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.166194  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 		 370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  28.16 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  27.79 
 
 		 371 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  25.71 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  26.5 
 
 		 344 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  26.46 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  25.07 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  28.2 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  27.06 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  25.86 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  26.75 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.04 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  26.61 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  26.87 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  26.26 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  25.58 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.07 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  22.92 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  25.61 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  24.65 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.16 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  25.99 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.81 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.18 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  24.75 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  25.39 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  24.44 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  24.84 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  24.84 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  24.66 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  26.37 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  24.78 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  25.95 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.16 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  28.25 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  23.75 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.71 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  24.18 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  23.34 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  25.44 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  23.61 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  24.49 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  24.85 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  24.55 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  23.51 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  22.88 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.53 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  23.27 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  25.22 
 
 		 356 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  23.28 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  24.66 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  24.37 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  22.97 
 
 		 309 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  22.97 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  21.96 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  24.85 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  21.43 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  27.51 
 
 		 310 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  23.94 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>