More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0222 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  59.73 
 
 		 311 aa  358  7e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  49.03 
 
 		 313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  46.76 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  44.67 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  43.1 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  45.36 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  43.09 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  43.45 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  45.88 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  42.5 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  40.41 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  41.46 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  44.16 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  47.17 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  41.39 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  42.81 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  35.41 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  41.37 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.4 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  37.34 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  38.77 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  36.96 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  33.75 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  33.94 
 
 		 294 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  32.28 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.35 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  32.18 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  32.18 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  32.18 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  31.17 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.92 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.64 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  31.71 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  28.81 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  29.94 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.07 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  27 
 
 		 310 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  29.08 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  29.56 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  28.81 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.91 
 
 		 345 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  28.42 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  29.12 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  29.06 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  29.33 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  28.29 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  27.01 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  27.4 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  28.22 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  25.67 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  27.42 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  27.42 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  27.89 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.08 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.41 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  26.3 
 
 		 341 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>