More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02035 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  51.3 
 
 		 313 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  47.91 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  50.9 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  46.96 
 
 		 315 aa  310  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  49.1 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  48.56 
 
 		 321 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  46.13 
 
 		 299 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  49.46 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  49.67 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  45.08 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  47.1 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  47.31 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  43.84 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  43.79 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  44.22 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  42.6 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  41.45 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  46.99 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  40.85 
 
 		 316 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  38.05 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.18 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  35.13 
 
 		 370 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.7 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  34.33 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.55 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.55 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  31.7 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  34.3 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.86 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35.2 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.42 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  34.66 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 371 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  33.33 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  32.47 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 346 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  33.01 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.35 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.52 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  32.7 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.13 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  32.48 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  31.68 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  29.56 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  29.03 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.54 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  31.46 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  29.67 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  30.17 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.78 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  30.17 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  28.37 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.9 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  28.68 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.33 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 339 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  26.62 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>