More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1041 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 303 aa  611  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  62.63 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  36.89 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  36.77 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  39.93 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  32.24 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  37.45 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  32.23 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  38.27 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.91 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.91 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.21 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  32.56 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  33.11 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  34.68 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  34.34 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  36.59 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  36.59 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  36.59 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  35.4 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  39.08 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  35.17 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  36.69 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  36.03 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  30.19 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  37.59 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  37.13 
 
 		 314 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  34.89 
 
 		 287 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  35.82 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  35.74 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  36.96 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  35.97 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.27 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.76 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.73 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.73 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.73 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.73 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.73 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  30.95 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  35.25 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  36.1 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  30.56 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  33.94 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  38.46 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  34.58 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  35.51 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  35.79 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  29.19 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  30.18 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  35.14 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  33.66 
 
 		 344 aa  165  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  30.04 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  35.04 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  32.69 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  32.48 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  27.33 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.04 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  32.63 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  36.11 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.96 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.84 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  30.19 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  33.9 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>