More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0669 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  77.02 
 
 
309 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  50.33 
 
 
311 aa  315  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  49.5 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  49.17 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  48.84 
 
 
311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  48.84 
 
 
311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  50.82 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  48.15 
 
 
313 aa  286  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  33.45 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 
297 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  32.66 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  32.66 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 
322 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 
316 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  33.55 
 
 
304 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  33.68 
 
 
286 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.85 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  35.71 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 
341 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  32.6 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  32.66 
 
 
294 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  30.64 
 
 
304 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 
305 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  32.56 
 
 
303 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  33.33 
 
 
304 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  32.36 
 
 
301 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  34.44 
 
 
302 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  32.15 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  33.87 
 
 
326 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  34.18 
 
 
310 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.24 
 
 
305 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.24 
 
 
305 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.91 
 
 
305 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.91 
 
 
305 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  31.91 
 
 
305 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 
324 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  30.84 
 
 
315 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  34.16 
 
 
292 aa  176  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 
313 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  31.88 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.8 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.95 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  30.87 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  34.14 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 
292 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  30.87 
 
 
303 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 
292 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  28.77 
 
 
312 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  26.97 
 
 
310 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  29.23 
 
 
313 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  33.22 
 
 
344 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  32.81 
 
 
299 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
303 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  33.93 
 
 
319 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 
300 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 
302 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.86 
 
 
325 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  30.22 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 
346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 
292 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 
304 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  28.71 
 
 
320 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 
306 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  32 
 
 
371 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 
317 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 
292 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  31.68 
 
 
303 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.28 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 
306 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.24 
 
 
301 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  28.37 
 
 
337 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 
316 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 
313 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 
326 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  32.38 
 
 
292 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 
301 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  30.14 
 
 
299 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  27.96 
 
 
300 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 
309 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 
315 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 
304 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 
294 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  28.95 
 
 
302 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 
315 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 
301 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 
303 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.6 
 
 
298 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>