More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1111 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  82.71 
 
 
304 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  81.13 
 
 
304 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  83.74 
 
 
294 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  76.01 
 
 
305 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  76.01 
 
 
305 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  76.01 
 
 
305 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  76.01 
 
 
305 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  76.01 
 
 
305 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  70.81 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  69.75 
 
 
324 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  69.18 
 
 
302 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  71.22 
 
 
300 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  67.62 
 
 
301 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  67.03 
 
 
316 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  69.78 
 
 
305 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  62.33 
 
 
304 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  61.64 
 
 
304 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  67.51 
 
 
314 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  61.56 
 
 
322 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  61.22 
 
 
311 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  65.92 
 
 
310 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  61.22 
 
 
322 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  65.56 
 
 
296 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  62.24 
 
 
286 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  64.44 
 
 
299 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  59.93 
 
 
297 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  60.14 
 
 
297 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  63.37 
 
 
301 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  59.78 
 
 
341 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  55.74 
 
 
311 aa  322  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  55.97 
 
 
326 aa  318  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  52.63 
 
 
315 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  55 
 
 
313 aa  300  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  49.5 
 
 
305 aa  298  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  50 
 
 
321 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  45.83 
 
 
290 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  49.62 
 
 
321 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  52.59 
 
 
346 aa  285  7e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  52.77 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  49.06 
 
 
337 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  48.33 
 
 
310 aa  279  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  46.33 
 
 
320 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  45.21 
 
 
320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  49.42 
 
 
287 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  48.71 
 
 
304 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  45.45 
 
 
316 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  44.19 
 
 
302 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  42.86 
 
 
302 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  48.01 
 
 
312 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  42.48 
 
 
299 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  42.86 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  34.09 
 
 
311 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  34.09 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  33.12 
 
 
311 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  33.12 
 
 
311 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  33.11 
 
 
311 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  36.92 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  35.54 
 
 
294 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 
304 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  34.03 
 
 
305 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 
303 aa  185  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.08 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 
302 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.63 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 
291 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 
311 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 
301 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 
303 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 
309 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.53 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  30.32 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.77 
 
 
313 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  36.33 
 
 
291 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  32.16 
 
 
309 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.55 
 
 
311 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.88 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  33 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
303 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 
325 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.18 
 
 
298 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 
321 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  34.1 
 
 
292 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 
326 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.18 
 
 
298 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 
301 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  32.33 
 
 
339 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 
289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 
309 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.08 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.49 
 
 
298 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 
316 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  31.38 
 
 
307 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 
292 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.03 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>