More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2025 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  54.03 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  53.65 
 
 		 311 aa  305  7e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  54.68 
 
 		 300 aa  304  9.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  48.7 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  49.13 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  49.32 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  46.98 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  48.75 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  45.45 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  45 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  46.52 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  46.82 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  43.31 
 
 		 311 aa  251  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  42.03 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  43.32 
 
 		 321 aa  248  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  46.64 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  44.96 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  47.74 
 
 		 323 aa  244  9e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  41.39 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  39.27 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  37.09 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.07 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  32.15 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.4 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  32.06 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  30.72 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.05 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.05 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  32.46 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  35.51 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.53 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  31.74 
 
 		 344 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.63 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.22 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  28.7 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.02 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  28.21 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  28.62 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  28.94 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  27.51 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  29.14 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 		 333 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  24.33 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  27.12 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  28.77 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  28.77 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  28.77 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.67 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_002620  TC0338  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.06 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.166194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  27.59 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.81 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  27.02 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  29.23 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  25.26 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>