More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1164 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 321 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  57.67 
 
 		 302 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  60.42 
 
 		 325 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  57.42 
 
 		 304 aa  318  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  54.25 
 
 		 306 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5108  periplasmic solute binding protein  53.95 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829709  normal  0.108422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4809  periplasmic solute binding protein  53.49 
 
 		 212 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4723  periplasmic solute binding protein  53.81 
 
 		 208 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.34 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.08 
 
 		 344 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  32.83 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  47.64 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  47.16 
 
 		 497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  36.75 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 		 371 aa  158  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  30.56 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.66 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  34.39 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  27.9 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  28.21 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  28.35 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.64 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  32.57 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  29.29 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  33 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  33.99 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.76 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  30.41 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.47 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.8 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.06 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.85 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  28.94 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.65 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  34.08 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  32.74 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.12 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.01 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  26.4 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  32.21 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  34.1 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.92 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  34.4 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  29.39 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.48 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  34.33 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.54 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  27.22 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.88 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  27.21 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  31.55 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  34.88 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  26.96 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  28.17 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  26.96 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  27.86 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  28.32 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  29.83 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>