More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0288 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 326 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  46.18 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  45.87 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  45.4 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  42.86 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  40.82 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  40.19 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  38.94 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  36.72 
 
 		 345 aa  222  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 		 371 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  40.36 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  40.07 
 
 		 344 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  33.87 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  32.06 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  29.94 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  30.79 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  30.79 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  29.84 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.41 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  28.73 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  31.95 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  27.44 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.27 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.43 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  26.2 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  25.64 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  26.93 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  27.39 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  27.21 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  27.49 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  26.21 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  27.56 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  24.25 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  28.17 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.81 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  24.69 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  29.64 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  23.9 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  28.11 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  24.67 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.12 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  28.78 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.48 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  27.12 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  27.4 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  23.42 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  27.44 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  25.64 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  26.86 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  27.21 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  24.61 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  27.21 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  28.16 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  26.57 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.94 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>