More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1775 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 312 aa  613  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  59.25 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  61.46 
 
 		 311 aa  341  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  52.24 
 
 		 311 aa  292  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  50.49 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  55.56 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  47.01 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  45.71 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  52.96 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  48.75 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  46.79 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  52.55 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  49.28 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  43.73 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  46.47 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  49.06 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  48.38 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  43.53 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  46.18 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  35.85 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  37.21 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.51 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  39.37 
 
 		 349 aa  198  7.999999999999999e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  36.82 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  34.46 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  32.69 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  35.44 
 
 		 333 aa  178  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  31.58 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  31.58 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.27 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  31.58 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  31.27 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.27 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  30.96 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  30.96 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.87 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.87 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  35.17 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  32.82 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  32.03 
 
 		 506 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.28 
 
 		 514 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  31.31 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.6 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  31.19 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  29.39 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.84 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  31.56 
 
 		 265 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 		 304 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.18 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 353 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.38 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  31.86 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  24.76 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.08 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.45 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  35.67 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  35.25 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  29.73 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28.17 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  28.07 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  24.84 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  29.49 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.66 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  30.24 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  26.93 
 
 		 515 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  26.93 
 
 		 515 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  32.52 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.62 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.62 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  23.93 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.62 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.62 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.34 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.62 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>