More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2430 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
515 aa  1043    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
515 aa  1043    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.87 
 
 
514 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  57.14 
 
 
331 aa  329  9e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  36.14 
 
 
506 aa  292  8e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  45.62 
 
 
315 aa  290  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  37.04 
 
 
316 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  36.65 
 
 
316 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  36.34 
 
 
316 aa  217  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  36.34 
 
 
316 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  36.34 
 
 
316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  36.02 
 
 
316 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  36.02 
 
 
316 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  36.02 
 
 
316 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  35.71 
 
 
316 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3847  hypothetical protein  53.76 
 
 
227 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496853  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0197  zinc-binding lipoprotein AcdA  53.67 
 
 
237 aa  210  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112655  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3117  hypothetical protein  53.23 
 
 
227 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  36.65 
 
 
316 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0187  hypothetical protein  52.54 
 
 
233 aa  207  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.410076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2197  pXO1-130 like-protein; C-terminal of zinc-binding protein AdcA  53.11 
 
 
239 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0004427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0201  hypothetical protein  47.26 
 
 
213 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287568  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1993  hypothetical protein  52.54 
 
 
213 aa  200  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.188381  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1353  hypothetical protein  51.41 
 
 
216 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000914461  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1917  hypothetical protein  51.41 
 
 
216 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000210584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1384  hypothetical protein  51.41 
 
 
216 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152062  normal  0.232737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1369  hypothetical protein  51.41 
 
 
216 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  hitchhiker  0.000590755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2098  hypothetical protein  51.41 
 
 
216 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0742941  hitchhiker  0.00000151144 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  33.94 
 
 
317 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  33.94 
 
 
317 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  33.43 
 
 
328 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1212  hypothetical protein  49.72 
 
 
216 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315082  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2074  hypothetical protein  49.15 
 
 
216 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9122e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1672  hypothetical protein  49.15 
 
 
223 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00489307  normal  0.127263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1678  Ribulose-phosphate 3-epimerase  49.15 
 
 
216 aa  183  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000135725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01888  conserved metal-binding protein  49.15 
 
 
216 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000894697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01878  hypothetical protein  49.15 
 
 
216 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000758272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2204  hypothetical protein  49.15 
 
 
216 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00801928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0910  hypothetical protein  49.15 
 
 
216 aa  183  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00199548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2752  hypothetical protein  48.59 
 
 
216 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00135234  normal  0.121988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 
314 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 
309 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  35.56 
 
 
265 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 
318 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  47.16 
 
 
469 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 
316 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  30.86 
 
 
314 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 
317 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 
304 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  28.31 
 
 
307 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 
304 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 
333 aa  146  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.19 
 
 
349 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 
332 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 
333 aa  144  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 
333 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.34 
 
 
320 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 
293 aa  143  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.18 
 
 
326 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 
358 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 
321 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 
304 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  27.18 
 
 
311 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.47 
 
 
345 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.91 
 
 
298 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 
324 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.84 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 
311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.3 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 
312 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 
331 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 
312 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 
293 aa  124  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.27 
 
 
323 aa  123  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.99 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  28.29 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 
287 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 
312 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 
315 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  24.41 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  26.86 
 
 
282 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.18 
 
 
300 aa  117  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  28.12 
 
 
280 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  29.06 
 
 
300 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  24.61 
 
 
312 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.16 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  28.09 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  24.45 
 
 
328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  24.08 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 
307 aa  111  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.01 
 
 
307 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  25.31 
 
 
346 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  32.7 
 
 
299 aa  108  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  25.94 
 
 
302 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>