More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0195 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  60.92 
 
 		 307 aa  348  8e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  55.56 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  53.87 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  49.19 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  54.81 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  48.34 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  41.18 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  39.86 
 
 		 290 aa  225  7e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.71 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  40.91 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  38.57 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  36.63 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  36.36 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  38.72 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  35.55 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  35.22 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  35.58 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.41 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  36.97 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  33.44 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  36.26 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 		 344 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  36.56 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.58 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.36 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  34.48 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  30.25 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.42 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  33.33 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  32.73 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.49 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  33.58 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.96 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  32.55 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.77 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.06 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  30.77 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.77 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  30.4 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.77 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.4 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.4 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.26 
 
 		 323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  30.4 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  33.06 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  33.2 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.81 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 469 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.71 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.71 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  26.76 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.96 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.96 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  27.97 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  28.74 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  27.9 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.24 
 
 		 346 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  28.26 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.31 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  28.77 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.23 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>