More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2383 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 
331 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
515 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
515 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  43.87 
 
 
315 aa  269  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  39.7 
 
 
316 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  40.18 
 
 
316 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  39.88 
 
 
316 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  39.09 
 
 
316 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  38.79 
 
 
316 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  38.79 
 
 
316 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  38.48 
 
 
316 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  38.48 
 
 
316 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  38.48 
 
 
316 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  39.04 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  33.85 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  33.53 
 
 
328 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  33.64 
 
 
317 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  33.64 
 
 
317 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  39.21 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  35.96 
 
 
314 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 
309 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 
316 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
304 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 
332 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 
307 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.09 
 
 
317 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.35 
 
 
326 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  28.66 
 
 
314 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.37 
 
 
514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
304 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  27.48 
 
 
333 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.94 
 
 
358 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 
345 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.75 
 
 
349 aa  142  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.19 
 
 
320 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.71 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  29.34 
 
 
311 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.31 
 
 
298 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 
304 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 
321 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  25.98 
 
 
313 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  28.76 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.84 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  27.63 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  27.81 
 
 
300 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  26.75 
 
 
346 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 
331 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 
287 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.44 
 
 
293 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.57 
 
 
307 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 
282 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 
293 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 
333 aa  123  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 
315 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 
324 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 
368 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  27.83 
 
 
312 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  24.44 
 
 
292 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 
298 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  27.44 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  31.02 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 
300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  24.4 
 
 
292 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  22.56 
 
 
292 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  28.49 
 
 
336 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  28.66 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  27.15 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  28.66 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  32.55 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  28.36 
 
 
311 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  24.56 
 
 
302 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 
298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 
305 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.36 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  25.83 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  25.17 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  23.03 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  25.34 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  30.3 
 
 
506 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
371 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.52 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.8 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  24.58 
 
 
347 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 
290 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  26.63 
 
 
313 aa  112  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>