More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0522 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 349 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  42.86 
 
 		 311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  46.83 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  43.15 
 
 		 311 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  44.44 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  41.4 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  44.58 
 
 		 331 aa  232  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.25 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  40.57 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  38.57 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  38.74 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  39.71 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.68 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  39.6 
 
 		 312 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  35.82 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  37.06 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  35.65 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  35.21 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30.86 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  34.82 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  29.13 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.73 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.73 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.47 
 
 		 514 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  31.27 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.65 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  27.79 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.94 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  29.46 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.84 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.43 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.43 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.14 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.14 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.55 
 
 		 316 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32.95 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.93 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  37.43 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.24 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.89 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  24.85 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.01 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.34 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  28.53 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  25.36 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  24.78 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.07 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  31.14 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  25.24 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  25.51 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  29.38 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.79 
 
 		 296 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  24.57 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  26.16 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  28.38 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.61 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  26.94 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  27.87 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.79 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.86 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  22.29 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.94 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.94 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  28.09 
 
 		 282 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 		 346 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  27.25 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  25.63 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  26.93 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  25.66 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.66 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  23.66 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18230  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.18 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>