More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2343 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 312 aa  620  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  48.19 
 
 		 358 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  48.56 
 
 		 331 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  55.96 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  52.9 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  49.28 
 
 		 312 aa  258  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  47.54 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  49.82 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  48.57 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  45.77 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  45.62 
 
 		 320 aa  244  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  40.31 
 
 		 314 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  46.72 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  47.94 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  43.84 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  40.72 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  40.69 
 
 		 308 aa  206  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  43.49 
 
 		 333 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  42.32 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  38.29 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.97 
 
 		 339 aa  191  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.41 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  37.24 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.71 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  36.39 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  35.13 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  35.17 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.31 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.31 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  37.01 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  34.62 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.81 
 
 		 514 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  35.79 
 
 		 506 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  29.88 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.38 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.21 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.21 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.88 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.88 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.88 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.71 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  34.04 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  31.8 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.56 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  33.84 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.07 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.34 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  32.67 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.34 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28.31 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  30.57 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.36 
 
 		 515 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.36 
 
 		 515 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  29.28 
 
 		 265 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.99 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.36 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  30.34 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.71 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.42 
 
 		 322 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  27.61 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.25 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.36 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.46 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  32.81 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  29.92 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  31.13 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  25.24 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  36.46 
 
 		 497 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  28.29 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  30.74 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.22 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  28.15 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>