More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0580 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 328 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  67.09 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  49.38 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  49.22 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  49.38 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  48.91 
 
 		 316 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  48.6 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  48.6 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  49.09 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  48.29 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  48.29 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  47.19 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  47.43 
 
 		 317 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  47.43 
 
 		 317 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  47.96 
 
 		 265 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  36.02 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  35.33 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  34.45 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  33.95 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.08 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.91 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  33.65 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  36.28 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  33.23 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  33.74 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  34.84 
 
 		 304 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.42 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.42 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  33.66 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.65 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  31.21 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.45 
 
 		 506 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.88 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.9 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.48 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.96 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  32.21 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.01 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  32.65 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.35 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  30.06 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  29.19 
 
 		 280 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.36 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.72 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  24.84 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.17 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  25.96 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  25.88 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  27.91 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  23.12 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  27.47 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.03 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.91 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  27.62 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.56 
 
 		 322 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  26.33 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.26 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>