More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2986 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  100 
 
 
326 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  67.87 
 
 
318 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  58.39 
 
 
316 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  54.93 
 
 
304 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  54.1 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  53.02 
 
 
333 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  50.65 
 
 
321 aa  299  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 
317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  39.94 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 
318 aa  209  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  32.92 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  33.23 
 
 
316 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  32.92 
 
 
316 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.6 
 
 
316 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  35.67 
 
 
307 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  32.92 
 
 
316 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  32.6 
 
 
316 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.6 
 
 
316 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  32.6 
 
 
316 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  31.66 
 
 
316 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  33.86 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  31.99 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 
333 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.51 
 
 
514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.94 
 
 
349 aa  179  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 
293 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 
333 aa  178  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.91 
 
 
332 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  37.42 
 
 
311 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.73 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  32.58 
 
 
265 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.41 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  36.66 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.87 
 
 
323 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  36 
 
 
311 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  34.71 
 
 
506 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 
306 aa  162  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  29.94 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  37.22 
 
 
315 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 
304 aa  160  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  37.33 
 
 
312 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  28.22 
 
 
328 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 
312 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.85 
 
 
320 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18230  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.41 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 
314 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 
296 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.25 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  36.95 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.02 
 
 
317 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.02 
 
 
317 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  29.81 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 
368 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 
282 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.06 
 
 
290 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 
313 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
304 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 
309 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 
301 aa  142  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.19 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  26.83 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.6 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  35.64 
 
 
294 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.84 
 
 
313 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 
346 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 
309 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 
331 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 
305 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.97 
 
 
323 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.87 
 
 
303 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.33 
 
 
322 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 
339 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  34.71 
 
 
307 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  31.69 
 
 
321 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  36.49 
 
 
320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.84 
 
 
311 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  32.99 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.23 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  30.96 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.53 
 
 
311 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.53 
 
 
311 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  30.37 
 
 
345 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 
323 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  34.28 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  28.17 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 
308 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32 
 
 
292 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.06 
 
 
339 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  32 
 
 
357 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  25.71 
 
 
280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  33.54 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.75 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  29.1 
 
 
320 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>