More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0895 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 
514 aa  1056    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  54.93 
 
 
506 aa  548  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.74 
 
 
515 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.74 
 
 
515 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  38.54 
 
 
309 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 
318 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.88 
 
 
349 aa  223  7e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  40.13 
 
 
314 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  36.52 
 
 
316 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  36.52 
 
 
316 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  36.52 
 
 
316 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  36.52 
 
 
316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  36.18 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  36.18 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  34.28 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  34.59 
 
 
316 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  36.75 
 
 
332 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  39.03 
 
 
280 aa  209  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 
316 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  36.56 
 
 
317 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  35.67 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1993  hypothetical protein  56.11 
 
 
213 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.188381  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  33.86 
 
 
328 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 
316 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2197  pXO1-130 like-protein; C-terminal of zinc-binding protein AdcA  50.54 
 
 
239 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0004427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2074  hypothetical protein  55.25 
 
 
216 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9122e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  33.93 
 
 
333 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  37.18 
 
 
333 aa  196  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01888  conserved metal-binding protein  54.7 
 
 
216 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000894697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  36.86 
 
 
307 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1672  hypothetical protein  54.7 
 
 
223 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00489307  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01878  hypothetical protein  54.7 
 
 
216 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000758272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0187  hypothetical protein  52.2 
 
 
233 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.410076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1212  hypothetical protein  54.7 
 
 
216 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315082  normal  0.401918 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1678  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.7 
 
 
216 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000135725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  36.68 
 
 
265 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0910  hypothetical protein  54.7 
 
 
216 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00199548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2204  hypothetical protein  54.7 
 
 
216 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00801928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 
316 aa  193  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2752  hypothetical protein  54.14 
 
 
216 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00135234  normal  0.121988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 
314 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  34.18 
 
 
304 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1917  hypothetical protein  51.96 
 
 
216 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000210584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1353  hypothetical protein  51.96 
 
 
216 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000914461  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1384  hypothetical protein  51.96 
 
 
216 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152062  normal  0.232737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1369  hypothetical protein  51.96 
 
 
216 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  hitchhiker  0.000590755 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0197  zinc-binding lipoprotein AcdA  50.55 
 
 
237 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112655  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2098  hypothetical protein  51.96 
 
 
216 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0742941  hitchhiker  0.00000151144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  33.82 
 
 
304 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  35.33 
 
 
293 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  34.71 
 
 
323 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  31.53 
 
 
317 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  31.53 
 
 
317 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 
318 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 
321 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  31.25 
 
 
326 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  34.66 
 
 
312 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3117  hypothetical protein  45.03 
 
 
227 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3847  hypothetical protein  44.5 
 
 
227 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496853  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  34.84 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
333 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0201  hypothetical protein  48.35 
 
 
213 aa  173  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287568  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 
311 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  34.73 
 
 
298 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  35.19 
 
 
306 aa  172  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.76 
 
 
320 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  34.97 
 
 
313 aa  170  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  36.27 
 
 
368 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 
311 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  42.86 
 
 
469 aa  163  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 
301 aa  163  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 
362 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  30.33 
 
 
290 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 
315 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 
294 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  35.41 
 
 
339 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  31.21 
 
 
311 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 
282 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
324 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 
331 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 
287 aa  150  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 
312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.25 
 
 
304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 
333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 
358 aa  146  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 
290 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 
300 aa  143  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18230  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.44 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.17 
 
 
323 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.69 
 
 
288 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 
306 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 
365 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 
308 aa  139  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  32.61 
 
 
331 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 
317 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 
323 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  31.21 
 
 
322 aa  134  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 
312 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>