26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1917 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1917  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000210584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1353  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000914461  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1384  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152062  normal  0.232737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1369  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  hitchhiker  0.000590755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2098  hypothetical protein  99.54 
 
 
216 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0742941  hitchhiker  0.00000151144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2074  hypothetical protein  72.22 
 
 
216 aa  351  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9122e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0910  hypothetical protein  72.22 
 
 
216 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00199548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2204  hypothetical protein  72.22 
 
 
216 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00801928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01888  conserved metal-binding protein  72.22 
 
 
216 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000894697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01878  hypothetical protein  72.22 
 
 
216 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000758272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1212  hypothetical protein  72.22 
 
 
216 aa  349  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315082  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1672  hypothetical protein  71.76 
 
 
223 aa  349  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00489307  normal  0.127263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1678  Ribulose-phosphate 3-epimerase  71.76 
 
 
216 aa  347  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000135725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2752  hypothetical protein  71.76 
 
 
216 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00135234  normal  0.121988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1993  hypothetical protein  69.91 
 
 
213 aa  332  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.188381  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  47.57 
 
 
469 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.41 
 
 
515 aa  194  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.41 
 
 
515 aa  194  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  51.96 
 
 
514 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  47.34 
 
 
506 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0187  hypothetical protein  48 
 
 
233 aa  178  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.410076  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3117  hypothetical protein  49.43 
 
 
227 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3847  hypothetical protein  49.43 
 
 
227 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496853  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2197  pXO1-130 like-protein; C-terminal of zinc-binding protein AdcA  43.96 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0004427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0201  hypothetical protein  40.48 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287568  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0197  zinc-binding lipoprotein AcdA  43.96 
 
 
237 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>