28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3117 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3847  hypothetical protein  98.68 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0201  hypothetical protein  55.66 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0187  hypothetical protein  62.5 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.410076  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0197  zinc-binding lipoprotein AcdA  48.1 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2197  pXO1-130 like-protein; C-terminal of zinc-binding protein AdcA  48.54 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0004427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.48 
 
 		 515 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.48 
 
 		 515 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1672  hypothetical protein  46.72 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00489307  normal  0.127263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1678  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000135725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2752  hypothetical protein  47.89 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00135234  normal  0.121988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2074  hypothetical protein  47.42 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9122e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1212  hypothetical protein  47.89 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315082  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01878  hypothetical protein  47.42 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000758272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01888  conserved metal-binding protein  47.42 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000894697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0910  hypothetical protein  47.42 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00199548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2204  hypothetical protein  47.42 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00801928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1993  hypothetical protein  48.22 
 
 		 213 aa  188  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.188381  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1369  hypothetical protein  46.19 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  hitchhiker  0.000590755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1384  hypothetical protein  46.19 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152062  normal  0.232737 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1353  hypothetical protein  46.19 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000914461  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1917  hypothetical protein  46.19 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000210584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2098  hypothetical protein  46.19 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0742941  hitchhiker  0.00000151144 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  46.15 
 
 		 506 aa  181  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  41.43 
 
 		 469 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  45.03 
 
 		 514 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0499  YodA domain protein  26.01 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000347899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2055  hemin-binding protein B  25.44 
 
 		 403 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>