More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0598 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
333 aa  679    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  37.8 
 
 
336 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18230  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.61 
 
 
365 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 
333 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  32.45 
 
 
318 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  31.38 
 
 
326 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.93 
 
 
318 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 
316 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  29.56 
 
 
321 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 
309 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.22 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 
304 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 
317 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.23 
 
 
349 aa  153  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 
316 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 
293 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  30.72 
 
 
506 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.1 
 
 
316 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.1 
 
 
316 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.79 
 
 
316 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.79 
 
 
316 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.19 
 
 
316 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.19 
 
 
316 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.19 
 
 
316 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.59 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 
333 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 
307 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  28.24 
 
 
317 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  28.24 
 
 
317 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  27.61 
 
 
312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 
328 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.89 
 
 
314 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 
315 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 
314 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 
322 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  27.63 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  27.63 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.61 
 
 
323 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 
341 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  28.02 
 
 
302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  28.61 
 
 
300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.83 
 
 
515 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.83 
 
 
515 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  24.36 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  24.33 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 
358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  24.4 
 
 
298 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  28.3 
 
 
306 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.36 
 
 
321 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  26.88 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.51 
 
 
307 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
310 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  26.16 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 
353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  27.49 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  26.38 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  27.78 
 
 
296 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 
294 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 
346 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 
304 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  25.76 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  25 
 
 
357 aa  109  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.69 
 
 
286 aa  109  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 
316 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  25.48 
 
 
316 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  21.62 
 
 
311 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  26.84 
 
 
287 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  26.75 
 
 
321 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  26.47 
 
 
297 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  26.52 
 
 
337 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  27.42 
 
 
302 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 
305 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 
282 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.09 
 
 
311 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 
331 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  26.79 
 
 
331 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  24.27 
 
 
324 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 
368 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 
297 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.44 
 
 
299 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 
296 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  23.67 
 
 
311 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 
339 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  24.68 
 
 
305 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  23.78 
 
 
320 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  28.7 
 
 
308 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  25.07 
 
 
315 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  26.65 
 
 
306 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  27.12 
 
 
301 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.05 
 
 
304 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  24.38 
 
 
353 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>