More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0278 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
293 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  40.19 
 
 
318 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  37.65 
 
 
332 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  38.83 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.37 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  34.08 
 
 
309 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  36.83 
 
 
317 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  36.83 
 
 
317 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  34.42 
 
 
307 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  36.79 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  36.12 
 
 
298 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  40 
 
 
301 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  36.14 
 
 
333 aa  192  6e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  34.6 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  35.89 
 
 
287 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 
314 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  36.9 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  32.66 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.5 
 
 
514 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  37.72 
 
 
296 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  34.78 
 
 
314 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 
328 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.98 
 
 
506 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  32.44 
 
 
321 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  36.04 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  32.8 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  33.12 
 
 
316 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  33.12 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  33.12 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  33.12 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  32.8 
 
 
316 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.15 
 
 
326 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 
316 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 
312 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  31.51 
 
 
316 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  31.19 
 
 
316 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.72 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  33.83 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31.12 
 
 
311 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 
282 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 
316 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 
345 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  33.66 
 
 
308 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 
311 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 
311 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  33.81 
 
 
290 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 
324 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 
331 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 
315 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.65 
 
 
320 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  31.35 
 
 
321 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  32.96 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  30.92 
 
 
321 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  32.95 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  30.1 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  32.59 
 
 
322 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  32.59 
 
 
311 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  30.79 
 
 
302 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 
333 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  33.08 
 
 
292 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  31.11 
 
 
304 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  29.88 
 
 
287 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  30.23 
 
 
322 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 
341 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  29.24 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.07 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  29.09 
 
 
305 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  32.05 
 
 
265 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  27.91 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.38 
 
 
365 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 
300 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  26.54 
 
 
294 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
301 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.92 
 
 
515 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.92 
 
 
515 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  30.31 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 
292 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  28.85 
 
 
311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  26.97 
 
 
310 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  31.37 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 
310 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  26.96 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.54 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  30.53 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  28.06 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  30.53 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  28.06 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>