More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1578 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 314 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  42.7 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  41.74 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  38.34 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  38.7 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  40.06 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  39.47 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  42.05 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  41.13 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  39.69 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  38.72 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  38.76 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.85 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.56 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.13 
 
 		 514 aa  220  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  34.92 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  36.33 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  39.31 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  35.45 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  35.26 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  33.88 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  36 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.54 
 
 		 506 aa  193  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.1 
 
 		 288 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  33.86 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  35.31 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  33.75 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  36.46 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  31.82 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  31.82 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  33.86 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  34.92 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  34.92 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.15 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  36.04 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.25 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  31.37 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.15 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  35.21 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  34.63 
 
 		 304 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.82 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.82 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  30.84 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  34.36 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.91 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  31.74 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.91 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.52 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  33.55 
 
 		 322 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  30.48 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  30.12 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  31.8 
 
 		 265 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.21 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.5 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.64 
 
 		 347 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.86 
 
 		 515 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.86 
 
 		 515 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.07 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  30.34 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  27.94 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  31.85 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.39 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  28.16 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 365 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  30.96 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  30.75 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.86 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>