More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0333 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 302 aa  624  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  55.17 
 
 		 303 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  39.01 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  33.77 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  33.82 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  32.41 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1008  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  33.68 
 
 		 322 aa  148  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 368 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  33.82 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  32.36 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  30.46 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.49 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  31.19 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  30.87 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  31.67 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.02 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  35.74 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.94 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  28.53 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  30.96 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  28.78 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  28.42 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  28.42 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.62 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.62 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.31 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.31 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.06 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  27.04 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  27.51 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  27.89 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.6 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.6 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  28.31 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  32.63 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  28.04 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.55 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  32.34 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.83 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  32.34 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 309 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.07 
 
 		 288 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 328 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2390  twin-arginine translocation pathway signal  29.83 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  26.96 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  27.38 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3595  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.235856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  26.91 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  34.66 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  27.87 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  30.93 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.07 
 
 		 514 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  26.6 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>