29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0201 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0201  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.287568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3117  hypothetical protein  61.2 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3847  hypothetical protein  61.75 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0187  hypothetical protein  60.8 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.410076  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0197  zinc-binding lipoprotein AcdA  47.77 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2197  pXO1-130 like-protein; C-terminal of zinc-binding protein AdcA  47.79 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0004427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.26 
 
 		 515 aa  203  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.26 
 
 		 515 aa  203  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  46.32 
 
 		 469 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  48.6 
 
 		 506 aa  181  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1678  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000135725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2074  hypothetical protein  43.48 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9122e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1212  hypothetical protein  43.48 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315082  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1672  hypothetical protein  43.48 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00489307  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0910  hypothetical protein  43.48 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00199548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2204  hypothetical protein  43.48 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00801928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01878  hypothetical protein  43 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000758272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01888  conserved metal-binding protein  43 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000894697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1993  hypothetical protein  43 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.188381  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2752  hypothetical protein  43 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00135234  normal  0.121988 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  48.35 
 
 		 514 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1369  hypothetical protein  40.48 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  hitchhiker  0.000590755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1384  hypothetical protein  40.48 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152062  normal  0.232737 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1353  hypothetical protein  40.48 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000914461  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1917  hypothetical protein  40.48 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000210584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2098  hypothetical protein  40 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0742941  hitchhiker  0.00000151144 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0499  YodA domain protein  25.57 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000347899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2055  hemin-binding protein B  26.23 
 
 		 403 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  36.23 
 
 		 1418 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>