More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3026 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  100 
 
 
302 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  48.16 
 
 
296 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  49.32 
 
 
302 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  45.42 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  46.15 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  42.28 
 
 
285 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  41.28 
 
 
300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  39.93 
 
 
310 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  43.67 
 
 
293 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  42.43 
 
 
313 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  43.07 
 
 
307 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  39.93 
 
 
323 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  38.87 
 
 
311 aa  226  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  41.11 
 
 
344 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  40.61 
 
 
294 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  38.91 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  38.64 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  39.56 
 
 
310 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  40.73 
 
 
310 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  42.16 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  41.84 
 
 
335 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.95 
 
 
345 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  36.79 
 
 
296 aa  209  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  38.54 
 
 
302 aa  205  6e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  35.23 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  35.56 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  38.2 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  38.38 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 
300 aa  195  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  37.72 
 
 
290 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.93 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.06 
 
 
296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.38 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.53 
 
 
291 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 
317 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
323 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  46.3 
 
 
469 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.69 
 
 
316 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.69 
 
 
316 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.69 
 
 
316 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.36 
 
 
316 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.36 
 
 
316 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.62 
 
 
278 aa  140  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 
296 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  29.9 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.95 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.3 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.48 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.52 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  23.81 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  23.81 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.7 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 
332 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 
301 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
333 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.64 
 
 
349 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  28.79 
 
 
265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.37 
 
 
318 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.66 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
311 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  24.75 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 
309 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.48 
 
 
311 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 
316 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  23.16 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 
304 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  23.99 
 
 
293 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 
276 aa  109  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 
309 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
353 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  28.12 
 
 
307 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  28.21 
 
 
307 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 
287 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  25.26 
 
 
331 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  26.49 
 
 
307 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  26.14 
 
 
328 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 
305 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  28.31 
 
 
333 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 
315 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 
309 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 
308 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0696  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.81 
 
 
276 aa  103  3e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 
346 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  26.26 
 
 
358 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  29.12 
 
 
311 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 
312 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.05 
 
 
316 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 
303 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>