More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1674 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  100 
 
 
311 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  54.85 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  59.14 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  47.83 
 
 
294 aa  308  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  48.08 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  47.57 
 
 
307 aa  296  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  48.34 
 
 
292 aa  279  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  38.54 
 
 
302 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  41.95 
 
 
302 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  40.29 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  33.57 
 
 
323 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 
310 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.27 
 
 
290 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  33.92 
 
 
290 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  39.38 
 
 
335 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  34.27 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  33.55 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  35.42 
 
 
344 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  34.03 
 
 
323 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 
312 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  35.41 
 
 
345 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 
310 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  32.53 
 
 
296 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  35.04 
 
 
293 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.3 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  31.47 
 
 
282 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  32.39 
 
 
302 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 
296 aa  162  9e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 
299 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 
317 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  30.71 
 
 
298 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  30 
 
 
298 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 
328 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.36 
 
 
332 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.93 
 
 
316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  28.57 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28.62 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.21 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.21 
 
 
316 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.21 
 
 
316 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.21 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  24.39 
 
 
317 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 
292 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  24.39 
 
 
317 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.86 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.13 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.1 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.52 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.92 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.38 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.53 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  27.38 
 
 
315 aa  126  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.38 
 
 
296 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  36.25 
 
 
469 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 
301 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.24 
 
 
323 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 
318 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.59 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  26.52 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.66 
 
 
304 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 
365 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  26.04 
 
 
314 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 
276 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 
294 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.96 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 
311 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  28.32 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.31 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 
309 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 
301 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 
321 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.09 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 
358 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  26.96 
 
 
326 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  27.44 
 
 
324 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  26.69 
 
 
311 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 
308 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 
311 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.19 
 
 
304 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
287 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 
302 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>