More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0119 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 344 aa  701    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  55.93 
 
 		 335 aa  335  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  47.88 
 
 		 302 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  44.38 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  47.31 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  42.46 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  41.31 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  46.62 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  40.98 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  46.04 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  44.69 
 
 		 285 aa  242  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  39.3 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  41.04 
 
 		 290 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.46 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  40.75 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  40.79 
 
 		 302 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  40.94 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  40.91 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  38.11 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  40.07 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.54 
 
 		 290 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  40.91 
 
 		 300 aa  219  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  37.18 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  38.41 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  40 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  37.17 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  37.91 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  40.58 
 
 		 294 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.33 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  35.38 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.34 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.3 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.19 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  35.26 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  34.74 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.19 
 
 		 278 aa  173  5e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  31.06 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  33.01 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  42.94 
 
 		 469 aa  145  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.71 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  31.9 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 346 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.79 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.51 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  27.13 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.15 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.2 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 		 298 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  32.08 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  31.62 
 
 		 298 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.74 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.42 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.42 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 316 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.42 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.1 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.31 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.1 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  29.15 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.1 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  30.06 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.77 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.93 
 
 		 301 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  29.12 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  29.6 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.2 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  30.84 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.31 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.54 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28.97 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  26.76 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>