More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1725 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 335 aa  679    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  57.76 
 
 		 344 aa  341  9e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  47.88 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  46.41 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  44.3 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  45.49 
 
 		 293 aa  252  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  45.67 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  41.31 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  42.14 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  40.96 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  44.01 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  40.27 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  38.41 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  35.65 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  41.5 
 
 		 302 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  41.7 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  36.42 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  37.73 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  36.42 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  39.06 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  36.94 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  37.74 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  37.93 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  35.6 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  35.44 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.57 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  37.37 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  35.74 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  31.53 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 282 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 345 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 323 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  35.06 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.18 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.46 
 
 		 278 aa  153  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  44.03 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.01 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 		 276 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.49 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  34.55 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.16 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.01 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.77 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.22 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  26.22 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.22 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.59 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.28 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.06 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  26.06 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.28 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  31.31 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  30.15 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.85 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  28.44 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.76 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  25.98 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.76 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  22.68 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  29.09 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  25.38 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  25.38 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  25.68 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.63 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  29.52 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>